Genes de resistencia a antibióticos beta-lactámicos en el microbioma del sistema de transporte público de Quito, Ecuador

Abstract

Las bacterias multirresistentes presentan mecanismos de resistencia frente a antibióticos β-lactámicos, como las β-lactamasas de espectro extendido (ESBL) y las metalo-β-lactamasas (MBL), las cuales están codificadas en operones en especies Gram negativas. Asimismo, las bacterias Gram positivas han desarrollado otros mecanismos a través de genes mec, que codifican proteínas de unión a penicilina modificadas (PBP2). El objetivo de este estudio fue determinar la presencia y dispersión de genes de resistencia a antibióticos β-lactámicos y del microbioma circulante en el sistema de transporte público de Quito (QTP). Se tomaron muestras mediante hisopado de 29 torniquetes de estaciones para extraer ADN ambiental superficial. Se realizaron PCR para detectar la presencia de 13 genes de resistencia a antibióticos, así como para identificar y amplificar el ADNr 16S para “barcoding”, seguido de análisis de clones, secuenciación Sanger y búsqueda en BLAST. Se detectaron genes ESBL blaTEM-1 y blaCTX-M-1, así como genes MBL blaOXA-181 y mecA en las estaciones del QTP, siendo blaTEM el más ampliamente distribuido. Se encontraron dos subvariantes para blaTEM-1, blaCTX-M-1 y blaOXA-181. Casi la mitad de las bacterias circulantes en las estaciones del QTP correspondieron a especies comunes del microbiota humano, incluyendo aquellas clasificadas por la OMS como patógenos de vigilancia crítica y de alta prioridad. Los genes de resistencia a antibióticos β-lactámicos son prevalentes en todo el QTP. Este es el primer reporte de blaOXA-181 en muestras ambientales en Ecuador. Además, se detectó una nueva variante putativa de este gen. Algunas bacterias comensales coagulasa negativas podrían desempeñar un papel como reservorios de resistencia mecA.