Caracterización genómica de Leuconostoc pseudomesenteroides UTNElla29 aislada de frutos de Morus nigra (L.): una cepa prometedora productora de exopolisacáridos

Abstract

Las bacterias ácido-lácticas producen diversos polisacáridos naturales que son secretados en la matriz celular y se encuentran unidos a la superficie celular o liberados en el entorno circundante. Debido a sus amplias aplicaciones en la industria alimentaria, la búsqueda de nuevas cepas productoras de polisacáridos continúa siendo de interés. En este estudio, se reporta la secuenciación y caracterización del genoma de Leuconostoc pseudomesenteroides cepa UTNElla29, aislada de frutos de Morus nigra (L.). Mediante el uso de diferentes herramientas in silico de “minería genómica”, se analizó su potencial genético. El tamaño del genoma se estimó en 2.272.560 pb, con un contenido de GC del 39,26 %. Del total de proteínas, 2170 presentaron correspondencia en la base de datos EggNOG. Se anotaron genes clave relacionados con la biosíntesis de aminoácidos, el metabolismo de carbohidratos y la producción de exopolisacáridos (EPS). El genoma alberga un profago intacto, un arreglo CRISPR y dos secuencias génicas putativas asociadas con el sistema CAS3 tipo I, y no presenta plásmidos, lo que indica estabilidad genética. Además, no se detectaron genes de resistencia adquirida, factores de virulencia o patogenicidad, ni aminas biógenas, lo que sugiere su inocuidad. Estudios preliminares in vitro mostraron que el rendimiento de EPS varió entre 0,4 y 10,2 g/L de biomasa seca, dependiendo del tamaño del inóculo y del tipo de azúcar en el medio MRS. Asimismo, se predijo la presencia de varios policétidos y terpenos, lo que indica la posibilidad de generar una amplia gama de compuestos naturales con diversas funciones biológicas. Sin embargo, estos resultados prometedores sugieren que la cepa Ella29 es una cepa beneficiosa que puede ser explotada adicionalmente in vitro para diversos usos tecnológicos.